Polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych mitochondrialnego DNA u sarny (Capreolus capreolus)

Mirosław Karpiński

University of Life Sciences in Lublin

Łukasz Adaszek

University of Life Sciences in Lublin

Leszek Drozd

University of Life Sciences in Lublin

Stanisław Winiarczyk

University of Life Sciences in Lublin

Piotr Czyżowski

University of Life Sciences in Lublin

Abstract

Celem badań było oszacowanie parametrów genetycznych dwóch subpopulacji saren (Capreolus capreolus), na podstawie polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych mitochondrialnego genu oksydoreduktazy cytochromowej b. Materiałem do badań było DNA z wycinków mięśni pobieranych z dwóch populacji sarny (Capreolus capreolus) pochodzących z Nadleśnictwa Białobrzegi i Zwierzyniec. W celu określenia różnic genetycznych pomiędzy dwoma populacjami wykonano reakcję PCR z użyciem starterów L14735, H15149 i porównano sekwencje nukleotydów uzyskanych amplikonów o długości 464 par zasad. Jednocześnie prze-prowadzono analizę statystyczną fragmentów restrykcyjnych (RFLP) dla trzech loci, wykorzystu-jąc endonukleazy HaeIII, HincII, SspI w obu badanych populacjach dzikich przeżuwaczy. Na podstawie frekwencji alleli wyliczono heterozygotyczność H (0,533–0,764), indeks stopnia poli-morfizmu PIC (0,375–0,661) oraz standardowy dystans genetyczny Ds (0,0094). Wykorzystując sekwencje nukleotydów, stworzono drzewo filogenetyczne ilustrujące zróżnicowanie genetyczne w badanych populacjach sarny. Badanie frekwencji alleli uzyskanych w metodą RFLP wykazało, że najbardziej polimorficznym spośród trzech loci wytypowanych do oceny zmienności genetycz-nej sarny jest locus Ssp I.

Keywords:

sarna, polimorfizm, mt-DNA, RFLP