Identyfikacja mieszańców międzyodmianowych Avena sativa L. oraz potencjalnych markerów dla genu karłowatości Dw6 z wy-korzystaniem metody ISSR
EDYTA PACZOS-GRZĘDA
Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, ul. Aka-demicka 15, 20-950 LublinAGNIESZKA GRĄDZIELEWSKA
Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, ul. Aka-demicka 15, 20-950 LublinAbstrakt
W efekcie krzyżowań międzyodmianowych, przeprowadzonych pomiędzy posiadającymi dominujący gen karłowatości Dw6 formami niskimi a liniami i odmianami wysokimi, uzyskano 147 ziarniaków reprezentujących 17 kombinacji. Mieszańcowy charakter sześciu kombinacji potwierdzał karłowy fenotyp roślin F1. Do weryfikacji pochodzenia pozostałych form zastosowano metodę ISSR. Z uwagi na wysoki poziom wykrywanego polimorfizmu metoda ISSR okazała się efektywna w identyfikacji mieszańców międzyodmianowych owsa. Ponadto spośród uzyskanych 150 polimorficznych produktów ISSR jeden (SR-37970) ulegał amplifikacji we wszystkich analizowanych formach karłowych. Produkt ten nie był powielany u żadnej z badanych roślin wysokich. Zidentyfikowany fragment po konwersji na marker SCAR może stanowić potencjalny marker dla genu karłowatości Dw6.
Słowa kluczowe:
ISSR, karłowatość, mieszańce międzyodmianowe, owies zwyczajnyBibliografia
Doyle J.J., Doyle J.L., 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochem. Bull. 19, 11–15.
Fernandez M., Figueiras A., Benito C., 2002. The use of ISSR and RAPD markers for detecting DNA polymorphism, genotype identification and genetic diversity among barley cultivars with known origin. Theor. Appl. Genet. 104, 845–851.
Farnham, M.W., Stuthman D.D., Biesboer D.D., 1990. Cellular expression of panicle exertion in semidwarf oat. Crop Sci. 30, 323–328.
Grądzielewska A., Paczos-Grzęda E., Gruszecka D., 2009. Zastosowanie metod RAPD i ISSR do oceny podobieństwa genetycznego greckich form Dasypyrum villosum (L.) P. Candargy. Biul. IHAR 253, 297–307.
Kramek A., Paczos-Grzęda E., 2010. Ocena zróżnicowania genetycznego polskich odmian pszenżyta ozimego za pomocą markerów ISSR. Zesz. Probl. Post. Nauk Roln. 555, 249–258.
Milach S.C., Rines H.W., Phillips R.L., 1997. Molecular genetic mapping of dwarfing genes in oat. Theor. Appl. Genet. 95, 783–790.
Molnar S.J., Chapados J.T., Satheeskumar S., Wight C.P., Bancroft B., Orr W., Luckert D.E., Kibite S., 2012. Comparative mapping of the oat Dw6/dw6 dwarfing locus using NILs and association with vacuolar proton ATPase subunit H. Theor. Appl. Genet. 124, 1115–1125.
Nei M., Li W.H., 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proc. Natl. Acad. Sci. 76, 5269–5273.
Paczos-Grzęda E., 2007. Wykorzystanie metod ISSR i RAPD oraz analizy rodowodów do oceny podobieństwa międzyodmianowego Avena sativa L. 2007. Zesz. Probl. Post. Nauk Roln. 517, 547–558.
Paczos-Grzęda E., Chrząstek M., Miazga D., Wacko S., 2006. Analiza molekularna mieszańców Avena sativa L. × A. maroccana Gdgr oraz A. sativa L. × A. murphyi Ladiz. PAGEN. Centre of Excellence in Plant Agrobiology and Molecular Genetics. Vol. 7. Mieszańce oddalone roślin uprawnych, 135–141.
Paczos-Grzęda E., Chrząstek M., Okoń S., Grądzielewska A., Miazga D., 2009. Zastosowanie markerów ISSR do analizy wewnątrzgatunkowego podobieństwa genetycznego Avena sterilis L. Biul. IHAR 252, 215–223.
Pejic I., Ajmone-Marsan P., Morgante M., Kozumplicck V., Castiglioni P., Taramino G., Motto M., 1998. Comparative analysis of genetic similarity among maize inbred lines detected by RFLPs, RAPDs, SSRs, and AFLPs. Theor. Appl. Genet. 97, 248–1255.
Rodkiewicz B., Śnieżko R., Fyk B., Niewęgłowska B., Tchórzewska D., 1994. Embriologia Angio-spermae – rozwojowa i eksperymentalna. Wydaw. UMCS, Lublin.
Rohlf F.J., 2001. NTSYS – pc numerical taxonomy and multivariate analysis system. Setauket, N.Y. Exeter Publish. Ltd.
Świerczewski A., Mazaraki M., 1993. Hodowla owsa. W: Biologia i agrotechnika owsa. Mazurek J. (red.). Wydaw. IUNG, Puławy.
Tanhuanpaa P., Kalendar R., Laurila J., Schulman A.H., Manninen O., Kiviharju E., 2006. Genera-tion of SNP markers for short straw in oat (Avena sativa L.). Genome 49, 282–287.
Thomas H., 1992. Cytogenetics of Avena. W: Oat science and technology, H.G. Marshall and M.E. Sorrells (eds.). American Society of Agronomy. Agronomy Monograf 33, Madison, Wis., USA 473–507.
Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D., 1994. Genome fingerprinting by simple-sequence repeat (SSR) – anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics 20, 176–183.
Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, ul. Aka-demicka 15, 20-950 Lublin
Instytut Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie, ul. Aka-demicka 15, 20-950 Lublin
Licencja
Artykuły są udostępniane na zasadach CC BY 4.0 (do 2020 r. na zasadach CC BY-NC-ND 4.0)..
Przysłanie artykułu do redakcji oznacza, że nie był on opublikowany wcześniej i nie jest rozpatrywany do publikacji gdzie indziej.
Autor podpisuje oświadczenie o oryginalności dzieła, wkładzie poszczególnych osób i źródle finansowania.
Samoarchiwizacja
Czasopismo Agronomy Science przyjęło politykę samoarchiwizacji nazwaną przez bazę Sherpa Romeo drogą niebieską. Od 2021 r. autorzy mogą samoarchiwizować postprinty artykułów oraz wersje wydawnicze (zgodnie z licencją CC BY). Artykuły z lat wcześniejszych (udostępniane na licencji CC BY-NC-ND 4.0) mogą być samoarchiwizowane tylko w wersji wydawniczej.
