Przejdź do głównego menu Przejdź do sekcji głównej Przejdź do stopki

Tom 33 Nr 3 (2015)

Articles

Porównawcze cytogenetyczne mapowanie locus HSPB1 w genomach bydłowatych

Przesłane: lipca 30, 2019
Opublikowane: 2015-11-26

Abstrakt

Białko HSPB1, z rodziny małych białek szoku cieplnego (sHsps), pełni funkcjonalną rolę w regulacji wielu procesów wewnątrzkomórkowych oraz ochronie przed stresowymi czynnikami środowiskowymi. Mutacje genu HSPB1 są przyczyną dysfunkcji komórek neuronowych, związanych z miopatiami, neuropatiami motorycznymi i zaburzeniami neurodegeneracyjnymi, w tym równieŜ z chorobami prionowymi. Precyzyjna, chromosomowa lokalizacja tego genu moŜe przyczynić się do identyfikacji nowego QTL skorelowanego z opornością/podatnością na choroby prionowe u bydłowatych. W wyniku porównawczego mapowania przeprowadzonego techniką FISH z gatunkowo specyficznymi i heterologicznymi sondami molekularnymi określono lokalizację genu HSPB1 w regionie 25q22 genomu bydła i kóz oraz 24q22 owiec. Fizyczna lokalizacja tego genu w genomach badanych gatunków określiła jego przynaleŜność do grup sprzęŜeniowych i syntenicznych, co jest istotne dla przewidywania skutków selekcji genetycznej.

Bibliografia

Acunzo J., Katsogiannou M., Rocchi P., 2012. Small heat proteins HSP27 (HspB1), αβ-crystallin (HspB5) and HSP22 (HspB8) as regulators of cell death. Int. J. Biochem. Cell B. 44, 1622–1631.

Arrigo A.P., 2012. Pathology-dependent effects linked to small heat shock proteins expression: an update. Scientifica, ID 185641, doi: org/10.6064/2012/185641.

Arrigo A.P., 2013. Human small heat shock proteins: Protein interactomes of homo- and heterooligomeric complexes: An update. FEBS Lett. 587, 1959–1969.

Bae S.E., Jung S, Kim H.Y., Son H.S., 2012. Correlation analysis for the incubation period of prion disease. Prion 6, 276–281.

Boncoraglio A., Minoia M., Carr S., 2012. The family of mammalian small heat shock proteins (HSPBs): Implications in protein deposit diseases and motor neuropathies. Int. J. Biochem. Cell Biol. 44, 1657–1669.

Brown C.A., Schmidt C., Poulter M., Hummerich H., Klöhn P.C., Jat P., Mead S., Collinge J., Lloyd S.E., 2014. In vitro screen of prion disease susceptibility genes using the scrapie cell assay. Hum. Mol. Genet. 2, 5102–5108.

Brownell S.E., Becker R.A., Steinman L., 2012. The protective and therapeutic function of small heat shock proteins in neurological diseases. Front. Immunol. 3, 74, doi: 10.3389/ fimmu.2012.00074.

Chowdhary B.P., Fronicke L., Gustavsson I., Scherthan H., 1996. Comparative analysis of the cattle and human genomes: detection of ZOO-FISH and gene mapping-based chromosomal homologies. Mamm. Genome 7, 297–302.

Danielak-Czech B., Kozubska-Sobocińska A., Bąk A., 2014a. FISH-based comparative mapping of the Hsp27 gene on chromosomes of the domestic Bovids. Chromosome Res. 22, 414–414.

Danielak-Czech B., Kozubska-Sobocińska A., Kruczek K., 2014 b. Chromosomal assignment of the small heat protein genes in the sheep genome. Chromosome Res. 22, 412–413.

Darlymple B.P., Kirkness E.F., Nefedov M., McWillam S., Ratnakumar A., Barris W., Zhao S., Shetty J., Maddox J.F., O’Grady M., Nicholas F., Crawford A.M., Smith T., de Jong P.J., McEwan J., Oddy V.H., Cockett N.E., International Sheep Genomics Consortium, 2007. Using comparative genomics to reorder the human genome sequence into a virtual sheep genome. Genome Biol. 8, R152, doi: 10.1186/gb-2007-8-7-r152.

De Lorenzi L., Molteni L., Parma P., 2010. FISH mapping in cattle (Bos taurus L.) is not yet of fashion. J. Appl. Genet. 51, 497–499.

Di Berardino D., Di Meo G.P., Gallagher D.S., Hayes H., Iannuzzi L., 2001. International system for chromosome nomenclature of domestic bovids ISCNDB 2000. Cytogenet. Cell Genet. 92, 283–299.

Everts-van der Wind A., Kata S.R., Band M.R., Rebeitz M., Larkin D.M., Everts R.E., Green C.A., Liu L., Natarajan S., Goldammer T., Lee J.H., McKay S., Womack J.E., Lewin H.A., 2004. A 1463 gene cattle-human comparative map with anchor points defined by human genome sequence coordinates. Genome Res. 14, 1424–1437.

Goldammer T., Di Meo G.P., Lühken G., Drögemüller C., Wu C.H., Kijas J., Dalrymple B.P., Nicholas F.W., Maddox J.F., Iannuzzi L., Cockett N.E., 2009. Molecular cytogenetics and gene mapping in sheep (Ovis aries, 2n = 54). Cytogenet. Genome Res. 126, 63–76.

Hernandez-Sanchez J., Waddington D., Wiener P., Haley C.S., Williams J.L., 2002. Genome-wide search for markers associated with bovine spongiform encephalopathy. Mamm. Genome 13, 164–168.

Hu Z.L., Park C.A., Wu X.L., Reccy J.M., 2013. Animal QTLdb: an improved database tool for livestock animal QTL/association data dissemination in the post-genome era. Nucleic Acids Res. 41, 871–879, doi: 10.1093/nar/gks1150.

Iannuzzi L., Di Berardino D., 2008. Tools of the trade: diagnostics and research in domestic animal cytogenetics. J. Appl. Genet. 49, 357–366.

Iannuzzi L., King W.A., Di Berardino D., 2009. Chromosome evolution in domestic bovids as revealed by chromosome banding and FISH-mapping techniques. Cytogenet. Genome Res. 126, 49–62.

Lewin H., Larkin D.M., Pontius J., O’Brien S.J., 2009. Every genome sequence needs a good map.
Genome Res. 19, 1925–1928.

Moreno C.R., Cosseddu G.M., Schibler L., Roig A., Moazami-Goudarzi K., Andreoletti O., Eychenne F., Lajous D., Schelcher F., Cribiu E.P., Laurent P., Vaiman D., Elsen J.M., 2008. Identification of new quantitative trait loci (other than the PRNP gene) modulating the scrapie incubation period in sheep. Genetics 179, 723–726.

Moreno C.R., Moazami-Goudarzi K., Briand S., Robert-Granié C., Weisbecker J.L., Laurent P., Cribiu E.P., Haley C.S., Andreoletti O., Bishop S.C., Pong-Wong R., 2010. Mapping of quantitative trait loci affecting classical scrapie incubation time in a population comprising several generations of scrapie-infected sheep. J. Gen. Virol. 91, 575–579.

Sawiris G.P., Becker K.G., Elliott E.J., Moulden R., Rohwer R.G., 2007. Molecular analysis of bovine spongiform encephalopathy infection by cDNA arrays. J. Gen. Virol. 88, 1356–1362.

Schibler L., Di Meo G.P., Iannuzzi L., 2009. Molecular cytogenetics and comparative mapping in goats (Capra hircus, 2n = 60). Cytogenet. Genome Res. 126, 77–85.

Serrano C., Bolea R., Lyahyai J., Filali H., Varona L., Marcos-Carcavilla A., Acin C., Calvo J.H., Serrano M., Badiola J.J., 2011. Changes in HSP gene and protein expression in natural scrapie with brain damage. Vet. Res. 42, 13, doi: 10.1186/1297-9716-42-13.

Tortosa R., Vidal E., Costa C., Alamillo E., Torres J.M., Ferrer I., Pumarola M., 2008. Stress response in the central nervous system of a transgenic mouse model of bovine spongiform encephalopathy. Vet. J. 178, 126–129.

Vidal E., Acín C., Foradada L., Monzόn M., Márquez M., Monleon E., Pumarola M., Badiola J.J., Bolea R., 2009. Immunohistochemical characterization of classical scrapie neuropathology in sheep. J. Comp. Pathol. 141, 135–146.

Wettstein G., Bellaye P.S., Micheau O., Bonniaud P., 2012. Small heat shock proteins and the cytoskeleton: An essential interplay for cell integrity? Int. J. Biochem. Cell B. 44(10), 1680–1686.

Zhang C., de Koning D.J., Hernandez–Sanchez J., Haley C.S., Williams J.L., Wiener P., 2004. Mapping of multiple quantitative trait loci affecting bovine spongiform encephalopathy. Genetics 167, 1863–1872.

Downloads

Download data is not yet available.

Inne teksty tego samego autora

1 2 3 4 5 > >> 

Podobne artykuły

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > >> 

Możesz również Rozpocznij zaawansowane wyszukiwanie podobieństw dla tego artykułu.